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       甲基化是表觀修飾的重要部分，DNA甲基化可以引起DNA構象、穩定性及DNA與蛋白質相互作用方式的改變，從而影響基因表達。DNA鏈中含有很多CpG結構，雙鏈DNA CpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲基化，基因組中60~90%的CpG都被甲基化，未甲基化的CpG成簇出現在基因啟動子核心序列或者轉錄起始位點。
       DNA甲基化轉移酶可以催化CpG的甲基化反應。DNA甲基化轉移酶有兩種，Dnmt1是一種持續性甲基化轉移酶，作用于只有一條鏈甲基化的DNA雙鏈，使其完全甲基化，參與DNA復制過程中新合成鏈的甲基化修飾；Dnmt3a/Dnmt3b是一種從頭甲基化轉移酶，可以在CpG上產生新的甲基化修飾，首先半甲基化，繼而全甲基化，該甲基化轉移酶可能參與細胞生長分化的調控，在腫瘤基因甲基化中起到重要作用。
       近年來CRISPR/Cas9技術得到快速發展，在基因切割活性失活的dCas9的5’端融合一個Dnmt3a，能夠通過dCas9介導特定位點的甲基化修飾，調控相關基因的表達。